Séquençage par Illumina et Pac Bio de l’ADN et de l’ARN humains et murins
Résumé public
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Health Canada appears to be seeking a long-term supplier of high-throughput DNA and RNA sequencing services using Illumina and Pacific Biosciences (Pac Bio Revio) platforms. The work would support four research projects involving human and mouse samples, including error-corrected next-generation sequencing, whole-genome sequencing, whole-exome sequencing, and RNA sequencing. The research is intended to identify mutations and gene-expression changes linked to chemical and environmental exposures, occupational hazards, and public-health risk assessment. The requirement may include sequencing pre-prepared DNA libraries, genomic DNA, and/or RNA, with projects funded through approximately 2030–2031. The listed service locations include Canada and several international regions; the buyer is the Department of Health (Health Canada), with the requirement associated with Ottawa, Ontario. The tender is listed as open and closes December 3, 2026 at 2:00 p.m. A Canadian laboratory, genomics provider, or specialized sequencing service company with relevant Illumina and/or Pac Bio capabilities potentially matches this opportunity, but the available information does not establish eligibility. Interested businesses should review the complete RFP for mandatory technical specifications, sample-handling and data requirements, security or privacy obligations, quality standards, contract terms, pricing instructions, and any experience or certification requirements. Verify all details, deadlines, submission procedures, and amendments in the official tender notice before submitting a bid.The provided tender document is: https://canadabuys.canada.ca/sites/default/files/webform/tender_notice/112090/1000273702_complete-rfp-%28final%28en.pdf
Aperçu des exigences
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- Provide high-throughput genome sequencing services for pre-prepared DNA libraries and genomic DNA and/or RNA.
- Support sequencing using Illumina and/or Pacific Biosciences (PacBio) Revio platforms.
- Sequence human and mouse materials, including error-corrected next-generation sequencing (ecNGS) DNA libraries, genomic DNA and/or RNA samples.
- Potentially provide ecNGS, whole-genome sequencing (WGS), whole-exome sequencing and/or RNA-sequencing services.
Aperçu de la description source
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La Division des études mécanistiques (DEM), qui relève du Bureau de la recherche et de la science en santé environnementale de Santé Canada, étudie les mécanismes par lesquels des agents physiques, chimiques et microbiologiques peuvent entraîner des effets néfastes sur la santé. Afin de déterminer comment les substances chimiques causent des dommages à l’ADN — susceptibles de mener à des maladies telles que le cancer ou des affections héréditaires —, la DEM a besoin de services de séquençage du génome à haut débit, utilisant les plateformes Illumina et Pacific Biosciences (Pac Bio). L’objectif principal de ce contrat est d’assurer, à long terme, des services de séquençage de haute qualité pour des banques d’ADN préparées au préalable, ainsi que pour de l’ADN génomique et/ou de l’ARN, en ayant recours aux plateformes Illumina ou Pac Bio Revio, et ce, pour toute la durée des projets financés, jusqu’en 2030-2031. Ce besoin englobe le séquençage de diverses banques d’ADN — incluant des banques préparées par séquençage de nouvelle génération avec correction d’erreurs (ecNGS) — ainsi que d’échantillons d’ADN génomique et/ou d’ARN, provenant de souris ou d’humains. Ces travaux appuient directement quatre projets de recherche distincts, répartis au sein de la Division et financés par trois programmes différents. Dans leur ensemble, ces projets mobilisent des technologies génomiques de pointe pour contribuer à la protection de la santé publique, notamment en identifiant des agents mutagènes environnementaux, en évaluant les risques professionnels et en améliorant les méthodologies d’essais toxicologiques. Plus précisément, ces travaux feront appel à des approches telles que l’ecNGS, le séquençage du génome entier (WGS), le séquençage de l’exome entier et/ou le séquençage de l’ARN. L’objectif est de détecter et de caractériser, dans l’ADN de souris et d’humains, les mutations spontanées ainsi que celles induites par des expositions chimiques ou environnementales, tout en examinant les changements dans l’expression des gènes. Les données ainsi obtenues permettront de mieux comprendre les mécanismes de mutagenèse et les dommages génétiques liés à l’exposition. Elles favoriseront également le développement de méthodes plus sensibles et plus informatives, utiles à la toxicologie génétique et à l’évaluation des risques pour la santé humaine.
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